El puerto de Marsala cuenta con importantes menciones en la historia de nuestro país, pero no sólo. Este puerto siempre ha atraído a los pueblos de los territorios vecinos por su posición estratégica en el Mediterráneo, funcional a la actividad comercial. De hecho, la ciudad fue un importante centro comercial desde sus orígenes. Tras la destrucción del puesto púnico de Mothia, los habitantes de la ciudad se asentaron en el promontorio opuesto de Lylibeo y reanudaron desde aquí sus actividades económicas.

El puerto de Lilybeo, al norte de la ciudad, a la derecha del Capo Boeo, se convirtió en paso obligado hacia África desde el primer milenio a.C. Fenicios, cartagineses y romanos desembarcaron en Marsala: Julio César en el 47 a. C. C. se refugió en Lilybaeum, donde se reunieron las legiones, pero también Poncio Pilato en el 31 a. C. C de camino a Palestina.

Su posición estratégica la convirtió en objeto de disputa entre cartagineses y romanos, hasta que estos últimos se impusieron con la victoria en la batalla de las Egadi en 241 a.C.

Decaído con el Imperio Romano y saqueado por los vándalos, el puerto de Marsala volvió a florecer con el interés de los árabes, que apreciaron tanto su situación y características que rebautizaron toda la ciudad con el nombre de “puerto de Ali”. La ciudad se convirtió en Marsa Alì, de donde deriva su nombre actual. Hubo que esperar a los siglos XIV y XV para que el antiguo puerto de Lilybaeum se convirtiera en el centro de muchos intereses, tanto españoles como franceses, otomanos y piratas. Cerrado desde 1572 a instancias de Juan de Austria, hijo del emperador Carlos V, que pensó en alejar los intereses de otros, el puerto permaneció inhabitable durante mucho tiempo.

Un nuevo impulso comercial se produjo con el interés de los británicos por la vocación vinícola de la zona, convirtiendo así el puerto de Marsala en el punto de partida de una nueva e intensa actividad comercial. En efecto, en 1816, el comerciante inglés J. Woodhouse, interesado por la excelente calidad del vino local, hizo construir un muelle de 800 metros en el lado sur de la ciudad para embarcar barriles en sus navíos. Esta estructura se continuó después con una suscripción de los habitantes de Marsala primero y del Decurionado en 1847 con el apoyo del gobierno borbónico.

El 11 de mayo de 1860, en el puerto de Marsala, entre los numerosos barcos británicos, se avistaron también las naves de Garibaldi y de los Mil, que desembarcaron aquí, en el mismo muelle construido por Woodhouse.

El puerto de Marsala es un puerto artificial delimitado por dos muelles costeros curvilíneos y un muelle exterior, con una entrada de 200 m de ancho. El muelle oriental, donde pueden atracar barcos pequeños, tiene 460 m de longitud, de los cuales sólo 50 m tienen muelles. En la parte sur del puerto hay también un puerto deportivo con capacidad para barcos de hasta 35 m de eslora.

Este puerto deportivo tiene disponibilidad de amarre para 236 embarcaciones, 18 para tránsito y una profundidad máxima de 4 metros. Una nota importante para los navegantes es la presencia de una boya a 5,5 millas al norte que marca el límite de las aguas seguras. El puerto deportivo tiene actualmente una estructura funcional, equipada con muelles, anillas, bolardos y escalas.

En 2014 se aprobó el proyecto definitivo para la creación del nuevo puerto turístico Marina di Marsala, construido por Marsala Yachting Resort srl, con la creación de una estructura que albergará 1.036 amarres para yates de hasta 75 metros de eslora y una amplia gama de servicios turísticos. Se trata de una obra destinada a mejorar la imagen que este territorio, y Sicilia en general, representa en el mundo en términos de atracción turística.

El proyecto también prevé la remodelación de toda la dársena portuaria para reasignar los espacios adecuados a todas las actividades portuarias existentes. También se ampliarán las obras de protección en la entrada del puerto y se desarrollará la profundidad operativa de la zona de carga hasta los 7 metros.

Los barcos más grandes dispondrán de un Mega Muelle específico de 8 metros de ancho, equipado con comodidad y seguridad. El suministro de combustible está situado en la cabecera del muelle rompeolas, en una zona resguardada y accesible sin rodeos para las embarcaciones. Entre los servicios adicionales del Puerto Deportivo se encuentra un astillero adaptado en tamaño y características al plan de atraque, con más de 14.000 metros cuadrados de astillero y 800 metros cuadrados de cobertizo, y un muelle de varada y botadura de hasta 9 metros de ancho. Está previsto que las obras del nuevo puerto finalicen en 2017.