Le port de Portbou est situé au sud de la baie de Portbou et touche la Punta de Gatillepis, le col du Puig del Claper et le Puig del Halcón entre la crête et le noyau urbain de Portbou. Le front côtier est constitué de falaises abruptes d’une grande hauteur, entrecoupées de quelques criques. L’activité du port se caractérise par l’amarrage de bateaux de sport et la mise à l’eau de tous types de navires, car il dispose d’un grand “Travell lift” et d’une zone terrestre pour l’hivernage, qui attire des bateaux de pêche et d’autres embarcations des ports environnants. Le port est relié à l’Edar (station d’épuration des eaux usées) de Portbou dans les deux sens, c’est-à-dire pour la surpression de l’eau, le nettoyage des bateaux ou la réutilisation des toilettes.